De Puzzle Quest serie is nooit zonder bugs geweest, maar de laatste die gevonden is, is wel erg pijnlijk. Volgens het forum op touchArcade worden hero's namelijk random verwijderd uit de game. Deze hero's moeten gered worden, maar om de een of andere vage reden blijken deze niet meer beschikbaar als er Continue Quest of Change Hero gekozen wordt.
Wat het nog vervelender maakt is dat deze hero's ook niet weer opnieuw vrijgespeeld kunnen worden omdat Puzzle Quest dan aangeeft dat deze al aanwezig is. Maar ook honderd keer opnieuw proberen lost het probleem niet op.
Transgaming Technologies, de developer die de game geport heeft naar de iPhone, heeft aangegeven met een onderzoek bezig te zijn.
